作为两岸周末包机大陆第一批开放航点城市，南京从2008年7月4日起正式开办两岸周末包机。 
    中国东方航空江苏有限公司承担飞行任务。首次航班MU5001将于7月4日上午8时从南京禄口国际机场出发，11时抵达台北松山机场，当天下午返回南京。该包机在今后的一段时间里，将在每周五执行一个往返的飞行任务：上午9时从南京禄口机场起飞，12时抵达台北松山机场；下午1时从台北松山机场起飞，下午4时抵达南京。 
    7月4日早7点，南京禄口机场将举办一场隆重的首航首发仪式。南京市台办主任赵再飞透露，首航首发仪式大概举行半小时左右，届时，海基会、国务院台办有关领导，以及省市主要领导将出席仪式。具体组成人员由30名游客代表、20名台商代表、各界领导、机场、机组人员、媒体记者，以及当天的其他航班乘客等300多人组成。仪式有致词、剪彩、献花、合影等活动，还有中国传统节目舞狮助兴表演。 
    据了解，首航首发的170名乘客包括100名游客和70名台胞。其中南京游客63名，主要由旅行社、旅游景区、旅游星级饭店、旅游院校老师等组成。 
    据了解，首发团7月4日启动后，南京市将从7月18日正式开始组团赴台旅游，目前由于具体操作和办证的要求尚在制订之中，江苏省中旅旅行社有限公司正对有赴台旅游意向的市民实行预报名，南京游客赴台旅游热情较高，目前预报人数已近1000人。 
    江苏是台商在大陆投资最密集的地区之一。台湾民营百强企业中已有60%以上在江苏投资设厂；到江苏投资的台资企业，80%以上已进入产出期，获得了良好的投资回报。
    原先从南京与台湾之间的货运与客运都需经第三地中转，全程需要6个多小时。南京首航点开通后，航程将缩短至3小时以内。业内人士认为，由于南京在沪宁杭都市圈中特殊的交通地理优势，开通与台湾的周末包机后，将会让长三角地区的更多台商和居民享受两地通行的便利，大大节省时间，降低两岸间的运费成本，降低商务成本，两岸的经贸往来将跨入一个崭新的局面。